Witam,
Ten problem rozwiązałem dawno temu ale na podstawie resztek moich notatek postaram się ci pomóc ...  
 
 
To było jakoś tak (użwam wersji 0.3.4 + mrtg-just 4.4 by MaciekS) ...
do konfigu Apache (plik httpd.conf) trzeba dodac jesli nie ma, poniższe wpisy:
    <Directory "/katalog/ze/skryptem">
    Options Indexes FollowSymLinks MultiViews ExecCGI
    AllowOverride None
    Order allow,deny
    Allow from all
    </Directory>
Oczywiście w miejse katalog ze skrytpem wstawiamy ścieżkę
do skryptu CGI ...
Żeby lepiej to zobrazować poniżej wygląd mojej sekcji z pliku httpd.conf:
  #
    # "/www/cgi" should be changed to whatever your ScriptAliased
    # CGI directory exists, if you have that configured.
    #
    <Directory "/www/mrtg-just">
        Options Indexes FollowSymLinks MultiViews ExecCGI
        AllowOverride None
#        Options None
        Order allow,deny
        Allow from all
    </Directory>
 
Oczywiście sprawdź prawa do skrytpu CGI ... najlepiej zrób:
chmod 555 status.cgi
Nie pamiętam dokładnie gdzie u mnie to siedzi (httpd.conf) ale chyba
jakoś tak: 
\boot\pkg\usr\local\apache\conf
Mam nadzieję że to pomoże ...  
 
 
Pozdrawiam
KrzychoG